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菌落PCR基因组模板快速制备方法

食用菌精准育种实验室-实验宝典
2023-10-14 / 0 评论 / 3 点赞 / 266 阅读 / 629 字

原创内容,欢迎转载,转载请注明出处


主笔:赵书雪、于浩

注意事项

1、本方法适合于酵母单菌落、蘑菇菌丝、蘑菇子实体、蘑菇晒干子实体等真菌样品的菌液PCR。

2、取蘑菇菌丝时,菌丝要求极少即可(肉眼看见就行),不要加入培养基;取蘑菇子实体时,用镊子取少量于离心管中,裂解时间可以适当加长;裂解酵母细胞时,肉眼看见浑浊即可,菌体不宜过多;晒干样品取组织的时候要尽量磨碎再加入。

3、金属提前打开设置到99摄氏度(使用水浴锅一定要防止污染)。

4、离心管加热过程,盖子容易崩开,必须要加离心管夹。


一、实验准备

1、细胞裂解液(配方详见:常见缓冲液配置方法

2、Taq酶,无菌超纯水,引物

3、移液枪、吸头、0.5 mL离心管(1.5 mL也行)、冰盒

4、金属浴,PCR仪


二、实验步骤

所有步骤必须要更换吸头,养成习惯,加相同的溶液,加ddH2O也要换吸头。

1、加入30 μL 细胞裂解液至0.5 mL离心管中(如果没有用1.5 mL离心管也行)(样品多可以多加点裂解液,如果使用1.5 mL离心管建议加30 μL)。

这里不使用0.2 mL离心管是因为没有0.2 mL离心管配套的离心管夹(防爆夹),并不是0.2 mL离心管不可以使用。

2、取待裂解样品少许至细胞裂解液中。

3、将离心管夹夹到离心管上面,将离心管放于金属浴中,99摄氏度反应25 min,中间取出快速混匀2次,防止菌体沉淀裂解不完全。

4、25 min后,取出离心管,裂解液即为基因组模板。

5、按照25~30 μL 体系加入1 μL 的基因组模板,进行PCR。


实验记录

  • 样本信息____
  • 样本类型____
  • 加入裂解液体积____
  • PCR反应体积____
  • 引物名称____
  • 裂解完成是否关闭水浴锅____
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