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质粒小提(试剂盒法)

食用菌精准育种实验室-实验宝典
2023-09-12 / 0 评论 / 1 点赞 / 398 阅读 / 1,372 字

说明

本实验方案是从大肠杆菌中提取质粒,其他的宿主细胞不适用。


一、实验准备

1、试剂盒(位于试剂盒架子上,不含Buffer P1):Vazyme FastPure® Plasmid Mini Kit(货号DC201)、生工 SanPrep 柱式质粒 DNA 小量抽提试剂盒(货号:B518191)

2、Buffer P1(位于公共冰箱4摄氏度)

3、1.5 mL离心管(普通离心管即可,最好事先进行灭菌)

4、超纯水(最好灭菌)

5、离心机、水浴锅、超微量分光光度计

6、菌株培养准备:灭菌的15 mL离心管,LB平板(含有特定的抗生素),灭菌后的LB培养基(公共冰箱4摄氏度)


二、注意事项

1、每次都要从单菌落开始,画好的单菌落的平板可以在公共冰箱4摄氏度放2个月,如果没有单菌落平板或者超期则需要从划单菌落开始,划单菌落参考其他教程。

2、每个步骤都要更换枪头,千万不要造成污染。

3、Buffer P1和Wash Solution(PW2)使用前检查是否打钩,没有打钩则加上响应试剂后打钩。

4、完成试验后Buffer P1放到4 ℃ 冰箱。


三、实验步骤

1、用灭菌枪头挑取1个单菌落,加入到含有合适的抗生素的10 mL LB液体培养基中(统一配置),于37℃摇床充分振荡培养15-20 h。

具体的质粒与抗生素对应关系请查看下面的连接:常用质粒抗性

2、每次取1~1.5 mL菌液加入到1.5 mL离心管中,室温,10,000 × g 离心1 min,丢掉上清,继续加菌液,最终离心~5 mL的菌液(低拷贝质粒可以超过5 mL,超过5 mL可能要增加试剂的使用量,会超过1.5mL离心管的容积)。

3、在菌体沉淀中加入250 μl Buffer P1,吸打或振荡至彻底悬浮菌体。【一定要检查P1是否打对勾,如果没有需要加入RNase A并打对勾】

4、加入250 μl Buffer P2,立即温和颠倒离心管5-10次混匀,室温静置1 min。

5、加入350 μl Buffer P3,立即温和颠倒离心管5-10 次充分混匀。

6、13,000 × g离心5 min,将上清全部小心移入吸附柱,静置1 min;9,000 × g离心30 sec。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。

65005b1b3f344.jpg

7、向吸附柱中加入500 μl Wash Solution(PW2),9,000 × g 离心30 sec。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。【一定要检查Wash Solution是否打钩,如果没有打钩质粒会被冲洗掉,加入乙醇后打钩】

8、重复步骤7 一次。

9、将空吸附柱和收集管放入离心机,10,000 × g 离心2 min 。打开吸附柱上盖,在室温晾5 min,使硅胶模上面的乙醇挥发掉。

10、取1 mL超纯水,放到1.5 mL离心管中,置于60摄氏度水浴锅中预热。

65005b1a9c682.jpg

11、将吸附柱放到一个新的1.5 mL新离心管中【一定要用一个新的离心管,否则质粒污染不能使用】。在吸附膜中央加入60 μL预热后的超纯水,静置1-2 min,9,000 × g离心1 min。

12、利用超微量分光光度计检测提取的质粒DNA的浓度,并将浓度写在离心管上面,将所得到的质粒DNA溶液置于-20℃保存或用于后续试验。


四、其他

1、首次使用前请短暂离心RNase A,将试剂盒提供的RNase A溶液全部加入Buffer P1中,置于4℃保存。

2、首次使用前按Buffer PW2瓶子标签所示,加入适量的无水乙醇稀释Buffer PW2,于室温保存。

3、冬季,Buffer P2、Buffer P3和Buffer PW1溶液容易产生白色沉淀,使用前可室温放置一段时间,必要时可在37℃水浴锅中预热至沉淀完全溶解,混匀后再使用。

4、质粒提取得率和质量与宿主菌的种类、质粒拷贝数,质粒的稳定性等因素有关,根据质粒不同灵活调整离心菌液的体积。

5、Buffer PW1可以有效去除残留的蛋白污染,当宿主菌为endA+(TG1、BL21、HB101、ET12567、JM系列)等核酸酶含量较高的菌株时,必须使用Buffer PW1。


实验记录

  • 从单菌落开始
  • 质粒名字____
  • 使用抗生素名字____
  • 大肠杆菌培养时间____h
  • 离心大肠杆菌体积____mL
  • P1已经打钩
  • Wash solution已经打钩
  • 使用超纯水洗脱质粒
  • 完成试验后Buffer P1放到4 ℃ 冰箱
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